สถานการณ์ใหม่บังคับให้ลิโลและเพื่อนต่างดาวของเธอต้องแยกทางกันในขณะที่กันตูและดร.แวน แฮมสเตอร์วิลสร้างโคลนสติทช์ที่ชื่อว่าลีรอยเพื่อจับการทดลองทั้งหมดและยึดครองกาแล็กซี